Η ΜΟΔ υποστηρίζει με ειδική ομάδα το Πράσινο Ταμείο σε όλο το φάσμα των δραστηριοτήτων του και παράλληλα συντρέχει στον σχεδιασμό των επιχειρησιακών του διεργασιών.

Στο πλαίσιο αυτής της συνεργασίας, και σε συνεννόηση με την ομάδα της ΜΟΔ που στηρίζει τον φορέα επί τόπου, η Διεύθυνση Υπηρεσιών Σχεδιασμού και Οργάνωσης (ΔΥΣΟ) της ΜΟΔ ολοκλήρωσε το σχέδιο Συστήματος Διαχείρισης και Ελέγχου του Πράσινου Ταμείου.

Το σύστημα περιλαμβάνει δύο τεύχη:

- Τεύχος 1: Ανάλυση και Περιγραφή των Επιχειρησιακών Διεργασιών

- Τεύχος 2: Κατηγοριοποίηση, Βήματα και Τεκμηρίωση των Διεργασιών

Το σχέδιο εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο του Πράσινου Ταμείου για πιλοτική εφαρμογή από τις 5 Σεπτεμβρίου 2022 ως τα τέλη Μαρτίου 2023,  ενώ από τον Απρίλιο 2023 αναμένεται να τεθεί σε πλήρη εφαρμογή.